《正当防卫》讲述了段鸿山（张鲁一饰）在办理“被家暴女性杀夫”案件时，意外杀人进了监狱，而随着案件真相的进一步调查，14年前一桩由他办理的旧案再次被翻了出来。

刑侦悬疑剧最怕剧情拖拖拉拉，故弄玄虚，而新剧不说废话，开局就三案并行将尺度拉满。

第一案：被家暴女性杀夫案。

江婷（叶青饰）被常年家暴跟丈夫提出了离婚，没想到对方却不肯放过她，一天夜里持刀来到江婷家想要再次施暴，而在生命遭受威胁下，江婷持刀反杀，共捅了对方七刀。

认为江婷是故意杀人、防卫过当的都有，而主办检察官段鸿山则主张江婷是正当防卫。

与此同时，案件出现转折，新的目击证人出面提供线索，但梅筝（张柏嘉饰）嘴上说是为了帮助江婷，但证词却将对方推到了故意杀人的方向。

案件扑朔迷离，事实真相尚不明朗，而此时，段鸿山出事了。

第二案：检察官杀人案。

深夜派出所，段鸿山浑身是血主动投案自首称自己杀了人，在他的叙述中，自己是被陌生男人绑架并生命遇到威胁，迫不得已反抗时意外杀害了绑匪，算是正当防卫。